質(zhì)譜分析/脂質(zhì)組學(xué)分析/靶標(biāo)(非靶標(biāo))代謝組分析
質(zhì)譜分析
中國(guó)生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)聯(lián)盟引進(jìn)美國(guó)安捷倫公司的液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀。形成了高通量、高靈敏度和高分辨率的規(guī)?;鞍踪|(zhì)分析支撐技術(shù)體系,為促進(jìn)蛋白質(zhì)組學(xué)及相關(guān)研究的發(fā)展,共享先進(jìn)的技術(shù)資源,近年來生物質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)室蛋白質(zhì)/多肽質(zhì)譜鑒定、生物工程藥物結(jié)構(gòu)確證和蛋白質(zhì)組學(xué)多項(xiàng)成熟的分析技術(shù)已為國(guó)內(nèi)外客戶提供了廣泛的服務(wù)。
設(shè)備儀器:
美國(guó)安捷倫公司Agilent (xct-6330) 型號(hào)的液相色譜儀,MS為美國(guó)熱電公司的TSQ型號(hào)質(zhì)譜儀;質(zhì)譜儀采用ESI(電噴霧電離)離子源,MS/MS 串連四極桿分析器??稍诰€檢測(cè)極性有機(jī)化合物、核酸、多肽、小分子蛋白質(zhì)及其化學(xué)修飾產(chǎn)品的實(shí)際分子量,并對(duì)送檢樣品進(jìn)行分子量鑒定,純度及修飾效果分析。
質(zhì)量范圍M/Z 10~2,000? 分辨率R=2M
測(cè)試范圍:?
多肽、蛋白質(zhì)的電噴霧質(zhì)譜分子量測(cè)定以及天然產(chǎn)物分子、生物大分子、有機(jī)分子的質(zhì)譜測(cè)試和研究
送檢樣品要求:樣品應(yīng)盡量不含鹽份、離子表面活性劑、去垢劑及一些難揮發(fā)性鹽。樣品送檢量、溶解方式以及未知可否做質(zhì)譜檢測(cè)的樣品可與我們的工作人員聯(lián)系以便提高檢測(cè)效率。
(送樣單請(qǐng)附帶檢測(cè)樣品的品名及精確計(jì)算分子量)
送樣須知:
A:樣品量:50pmol干粉或1ug/uL以上(一般測(cè)試)、100pmol干粉或1ug/uL以上(MALDI串聯(lián)質(zhì)譜分析)、100ug干粉以上(二硫鍵分析、糖基化分析,磷酸化分析,其他修飾分析)、10ug干粉以上(SDS-PAGE或IEF);
B:鹽含量:揮發(fā)性無(wú)機(jī)鹽,<20mM,請(qǐng)勿使用PBS、SDS和尿素等質(zhì)譜干擾物質(zhì);
C:考馬斯亮藍(lán)染色樣品可全部接收,銀染過程中不得使用戊二醛作為固定劑;
D:請(qǐng)告知樣品是否有修飾,并請(qǐng)注明修飾方式。
主要應(yīng)用 :?
*?蛋白質(zhì)組學(xué)研究 *?寡聚糖和糖蛋白的研究 *?小分子化合物分析
*?藥物發(fā)現(xiàn)和研發(fā) *?食品和環(huán)境樣品分析
檢測(cè)報(bào)告:
從收到樣品起1-2個(gè)工作日內(nèi)可給出樣品的檢測(cè)報(bào)告,以電子郵件的形式發(fā)給您并附帶檢測(cè)結(jié)果分析。包括結(jié)果有:銷售質(zhì)譜:質(zhì)譜圖、肽段分子量、數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果;? 二級(jí)質(zhì)譜:質(zhì)譜圖、肽段分子量、數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果、肽段氨基酸序列、修飾位點(diǎn)等。
脂質(zhì)組學(xué)分析
對(duì)脂類的準(zhǔn)確鑒定和絕對(duì)定量在脂質(zhì)代謝的綜合研究中起著重要的作用。基于穩(wěn)定同位素標(biāo)記內(nèi)標(biāo)(SIL-IS)及響應(yīng)因子(RF)建立的脂質(zhì)組全定量庫(kù),可對(duì)Plasmenyl-glycerophosphatidylcholine(pPC)、Lysoglycerophosphatidylcholine(LPC)和Sphinganine(Sph)等多達(dá)34類脂質(zhì)進(jìn)行準(zhǔn)確定性以及絕對(duì)定量。相較于傳統(tǒng)的脂質(zhì)組學(xué)檢測(cè)方法需要添加 多種SIL-IS的弊端,我們通過引入RF使得我們的脂質(zhì)組全定量方法,在保持與傳統(tǒng)方法相當(dāng)定量精度以及日間重復(fù)性的基礎(chǔ)上,可定性定量物質(zhì)種類更多、通量更高。通過對(duì)我們包含76361種脂質(zhì)、181300張MS/MS二級(jí)質(zhì)譜圖的自建脂質(zhì)二級(jí)質(zhì)譜庫(kù)的檢索匹配,我們可以僅用單個(gè)SIL-IS,對(duì)生物樣本種數(shù)萬(wàn)種脂質(zhì)同時(shí)進(jìn)行準(zhǔn)確定性以及絕對(duì)定量,且上述工作均基于計(jì)算機(jī)程序自動(dòng)化運(yùn)作,高效便捷。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
脂質(zhì)檢測(cè)效率高:可實(shí)現(xiàn)單一SIL-IS同時(shí)高通量定性,絕對(duì)定量上萬(wàn)種脂質(zhì);
專業(yè)團(tuán)隊(duì)檢測(cè)分析:通過計(jì)算機(jī)程序自動(dòng)化運(yùn)行。
樣本要求
植物組織? ? ? ? ? ? ? ? ? 200-500 mg
動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本? ? ?????200 mg
血清、血漿? ? ? ? ? ? ? ? ?200 μL
微生物、細(xì)胞? ? ? ? ? ? 1×107?cells
生物學(xué)重復(fù)
樣本數(shù)量:植物和微生物n≥6,動(dòng)物樣本n≥10,臨床樣本n≥30,所有重復(fù)樣本獨(dú)立分析。
檢測(cè)平臺(tái)
UHPLC-QTOF-MS(Agilent 1290 UHPLC-AB 6600/5600 MS)
UHPLC-QE-MS(Agilent 1290 UHPLC-Thermo Q Exactive Focus/Plus/HF)
檢測(cè)范圍
pPC、LPC、Sph、Cer、SM、Cer-p、PhytoSph和HexCer等34類脂質(zhì)
應(yīng)用方向
1、通過分析各種代謝性疾病的不同代謝途徑的脂質(zhì)成分變化,揭示出相關(guān)疾病發(fā)生、發(fā)展過程中脂質(zhì)成分的功能和影響;
2、通過比較不同處理,生物樣本中脂質(zhì)成分的差異,探究脂質(zhì)成分的生物學(xué)功能。?
靶標(biāo)代謝流分析
基于13C或者15N標(biāo)記的靶標(biāo)代謝流分析能夠系統(tǒng)地定量細(xì)胞或者組織內(nèi)特定代謝通路代謝網(wǎng)絡(luò)的流量分布及各代謝途徑的相對(duì)貢獻(xiàn),其優(yōu)點(diǎn)是可以利用細(xì)胞內(nèi)代謝物的質(zhì)量同位體信息的分析方法,不但在很多情況下能夠直觀地表明代謝流量的整體走向,而且通過計(jì)算能夠準(zhǔn)確定量地揭示細(xì)胞內(nèi)各個(gè)代謝反應(yīng)的活性,以及深入理解平行反應(yīng)、可逆反應(yīng)等多種復(fù)雜的細(xì)胞內(nèi)代謝過程,直觀揭示細(xì)胞胞內(nèi)的主要活性途徑及各個(gè)途徑的相對(duì)貢獻(xiàn)及其分布變化特點(diǎn),從而鑒定出相關(guān)疾病發(fā)生發(fā)展過程的早期診斷的標(biāo)志物及其關(guān)鍵的主要代謝通路,并揭示其相互調(diào)控規(guī)律,為疾病發(fā)生的臨床早期診斷、藥物靶點(diǎn)治療和預(yù)后判斷提供強(qiáng)有力的科學(xué)依據(jù)。?
檢測(cè)范圍
基于13C 標(biāo)記的葡萄糖(Glucose)碳代謝流分析
基于13C標(biāo)記的谷氨酰胺(Glutamine)碳代謝流分析
基于15N標(biāo)記的谷氨酰胺(Glutamine)氮代謝流分析
非靶標(biāo)代謝流分析
經(jīng)典代謝組學(xué)可以反映機(jī)體代謝物的變化及可能被激活的通路,但同一代謝物可能參與多條代謝通路而其豐度不發(fā)生變化。非靶標(biāo)代謝流可以研究代謝流量隨時(shí)間的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律,不限于特定的代謝通路,對(duì)流經(jīng)代謝途徑的代謝流量組進(jìn)行定量分析,能夠很好的解釋代謝物在生物途徑中何如變化,將代謝組學(xué)的研究提升到更高的水平和層次。代謝流分析尤其是基于13C標(biāo)記的代謝流技術(shù)已成為近年來的研究熱點(diǎn)技術(shù)之一。?
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
分辨率高:可以分辨同位素標(biāo)記和非標(biāo)記代謝物;
與靶標(biāo)代謝流相比,非靶標(biāo)代謝流不限于特定的代謝通路,可對(duì)標(biāo)記的代謝物進(jìn)行流向分析。